Der Stachelschwanzwaran ist als Einzelgänger am Tag aktiv. Nachts und auch oft am Tag versteckt er sich in Felsspalten oder unter Felsen. Dabei legt er den Schwanz so, dass er den überwiegenden Teil des Körpers zum Eingang hin abschirmt, um nächtliche Fressfeinde mit den entgegen gerichteten Stacheln abzuschrecken. Stachelschwanzwarane fressen Insekten wie Heuschrecken, Käfer und Schaben sowie kleine Echsen wie Geckos, Skinke und kleine Agamen. Seltener frisst der Stachelschwanzwaran sonstige Insekten, Spinnen, Schnecken oder junge Beutelsäuger. Er muss nur wenig trinken, denn seinen Wasserbedarf deckt der Stachelschwanzwaran wohl zu etwa 70 % aus seiner Nahrung. Die Weibchen vergraben das Gelege aus 4 - 17 ledrigen Eiern im feuchten Boden. Abhängig von der Temperatur schlüpfen die Jungtiere nach etwa 4 - 5 Monaten.
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